Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SKIV2LQ15477 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIV2LQ15477 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.7 ms