Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF4Q15306 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF4Q15306 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF4Q15306 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF4Q15306 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF4Q15306 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF4Q15306 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF4Q15306 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF4Q15306 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF4Q15306 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF4Q15306 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF4Q15306 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF4Q15306 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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