Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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PDCD1Q15116 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PDCD1Q15116 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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