Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KARSQ15046 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KARSQ15046 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KARSQ15046 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KARSQ15046 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KARSQ15046 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KARSQ15046 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KARSQ15046 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KARSQ15046 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KARSQ15046 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KARSQ15046 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KARSQ15046 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KARSQ15046 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KARSQ15046 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KARSQ15046 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KARSQ15046 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KARSQ15046 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KARSQ15046 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KARSQ15046 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KARSQ15046 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KARSQ15046 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KARSQ15046 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KARSQ15046 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KARSQ15046 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KARSQ15046 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KARSQ15046 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KARSQ15046 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KARSQ15046 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KARSQ15046 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KARSQ15046 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KARSQ15046 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KARSQ15046 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KARSQ15046 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KARSQ15046 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KARSQ15046 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KARSQ15046 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KARSQ15046 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KARSQ15046 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KARSQ15046 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KARSQ15046 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KARSQ15046 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KARSQ15046 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KARSQ15046 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KARSQ15046 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KARSQ15046 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KARSQ15046 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KARSQ15046 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KARSQ15046 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KARSQ15046 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KARSQ15046 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KARSQ15046 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KARSQ15046 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KARSQ15046 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KARSQ15046 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KARSQ15046 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KARSQ15046 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KARSQ15046 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KARSQ15046 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KARSQ15046 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KARSQ15046 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KARSQ15046 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KARSQ15046 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KARSQ15046 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KARSQ15046 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KARSQ15046 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KARSQ15046 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KARSQ15046 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KARSQ15046 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KARSQ15046 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KARSQ15046 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KARSQ15046 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KARSQ15046 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KARSQ15046 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KARSQ15046 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KARSQ15046 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KARSQ15046 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KARSQ15046 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KARSQ15046 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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