Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHPRHQ149N8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SHPRHQ149N8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
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