Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF235Q14590 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF235Q14590 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF235Q14590 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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