Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3AQ14563 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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