Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IKBKEQ14164 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IKBKEQ14164 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKEQ14164 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKEQ14164 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKEQ14164 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKEQ14164 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKEQ14164 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKEQ14164 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKEQ14164 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKEQ14164 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms