Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE4AQ14139 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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UBE4AQ14139 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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UBE4AQ14139 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE4AQ14139 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBE4AQ14139 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
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