Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NID2Q14112 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NID2Q14112 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NID2Q14112 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NID2Q14112 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NID2Q14112 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NID2Q14112 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NID2Q14112 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NID2Q14112 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NID2Q14112 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NID2Q14112 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NID2Q14112 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NID2Q14112 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NID2Q14112 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NID2Q14112 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NID2Q14112 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NID2Q14112 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NID2Q14112 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NID2Q14112 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NID2Q14112 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NID2Q14112 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NID2Q14112 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NID2Q14112 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NID2Q14112 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NID2Q14112 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NID2Q14112 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NID2Q14112 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NID2Q14112 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NID2Q14112 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NID2Q14112 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NID2Q14112 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NID2Q14112 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NID2Q14112 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NID2Q14112 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NID2Q14112 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NID2Q14112 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NID2Q14112 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NID2Q14112 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NID2Q14112 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NID2Q14112 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NID2Q14112 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NID2Q14112 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NID2Q14112 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NID2Q14112 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NID2Q14112 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NID2Q14112 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NID2Q14112 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NID2Q14112 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NID2Q14112 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NID2Q14112 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NID2Q14112 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NID2Q14112 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NID2Q14112 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NID2Q14112 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NID2Q14112 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NID2Q14112 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NID2Q14112 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NID2Q14112 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NID2Q14112 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NID2Q14112 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NID2Q14112 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NID2Q14112 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NID2Q14112 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NID2Q14112 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NID2Q14112 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NID2Q14112 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NID2Q14112 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NID2Q14112 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NID2Q14112 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NID2Q14112 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NID2Q14112 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NID2Q14112 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NID2Q14112 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NID2Q14112 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NID2Q14112 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NID2Q14112 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NID2Q14112 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NID2Q14112 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NID2Q14112 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NID2Q14112 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NID2Q14112 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NID2Q14112 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NID2Q14112 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NID2Q14112 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NID2Q14112 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NID2Q14112 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NID2Q14112 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NID2Q14112 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NID2Q14112 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NID2Q14112 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NID2Q14112 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NID2Q14112 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NID2Q14112 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NID2Q14112 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NID2Q14112 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NID2Q14112 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NID2Q14112 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NID2Q14112 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NID2Q14112 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NID2Q14112 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
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