Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIRBPQ14011 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CIRBPQ14011 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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