Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NCOA4Q13772 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA4Q13772 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCOA4Q13772 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
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