Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC1Q13547 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HDAC1Q13547 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC1Q13547 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
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