Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF4BQ13523 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF4BQ13523 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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