Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TCOF1Q13428 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TCOF1Q13428 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TCOF1Q13428 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TCOF1Q13428 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TCOF1Q13428 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
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