Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL49Q13405 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MRPL49Q13405 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRPL49Q13405 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL49Q13405 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL49Q13405 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRPL49Q13405 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL49Q13405 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL49Q13405 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL49Q13405 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL49Q13405 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL49Q13405 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL49Q13405 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL49Q13405 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL49Q13405 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL49Q13405 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL49Q13405 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL49Q13405 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL49Q13405 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL49Q13405 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MRPL49Q13405 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL49Q13405 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL49Q13405 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL49Q13405 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL49Q13405 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL49Q13405 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRPL49Q13405 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRPL49Q13405 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL49Q13405 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL49Q13405 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL49Q13405 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL49Q13405 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRPL49Q13405 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL49Q13405 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL49Q13405 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRPL49Q13405 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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