Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMS2P3Q13401 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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