Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP3B2Q13367 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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