Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLF1Q13351 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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