Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5R2Q13319 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK5R2Q13319 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5R2Q13319 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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