Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMQ13315 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMQ13315 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMQ13315 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMQ13315 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMQ13315 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMQ13315 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMQ13315 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMQ13315 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMQ13315 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMQ13315 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMQ13315 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMQ13315 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMQ13315 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMQ13315 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMQ13315 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMQ13315 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMQ13315 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMQ13315 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMQ13315 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMQ13315 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMQ13315 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMQ13315 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMQ13315 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMQ13315 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMQ13315 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMQ13315 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMQ13315 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMQ13315 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMQ13315 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMQ13315 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMQ13315 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMQ13315 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMQ13315 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMQ13315 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMQ13315 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMQ13315 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATMQ13315 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATMQ13315 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATMQ13315 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATMQ13315 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATMQ13315 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATMQ13315 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATMQ13315 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATMQ13315 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATMQ13315 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATMQ13315 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATMQ13315 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATMQ13315 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATMQ13315 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATMQ13315 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATMQ13315 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATMQ13315 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATMQ13315 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATMQ13315 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATMQ13315 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATMQ13315 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATMQ13315 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATMQ13315 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATMQ13315 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATMQ13315 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATMQ13315 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATMQ13315 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATMQ13315 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATMQ13315 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATMQ13315 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATMQ13315 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATMQ13315 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATMQ13315 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATMQ13315 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATMQ13315 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATMQ13315 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATMQ13315 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATMQ13315 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATMQ13315 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATMQ13315 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATMQ13315 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATMQ13315 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATMQ13315 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATMQ13315 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATMQ13315 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATMQ13315 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATMQ13315 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATMQ13315 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATMQ13315 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATMQ13315 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATMQ13315 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATMQ13315 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATMQ13315 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATMQ13315 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATMQ13315 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATMQ13315 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATMQ13315 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATMQ13315 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATMQ13315 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATMQ13315 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATMQ13315 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATMQ13315 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATMQ13315 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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