Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME3Q13232 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME3Q13232 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME3Q13232 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME3Q13232 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME3Q13232 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME3Q13232 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME3Q13232 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME3Q13232 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME3Q13232 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME3Q13232 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME3Q13232 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME3Q13232 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME3Q13232 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NME3Q13232 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME3Q13232 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME3Q13232 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME3Q13232 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME3Q13232 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME3Q13232 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME3Q13232 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME3Q13232 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME3Q13232 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NME3Q13232 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME3Q13232 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME3Q13232 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME3Q13232 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME3Q13232 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME3Q13232 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME3Q13232 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME3Q13232 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME3Q13232 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME3Q13232 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME3Q13232 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME3Q13232 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME3Q13232 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME3Q13232 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME3Q13232 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME3Q13232 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NME3Q13232 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME3Q13232 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME3Q13232 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME3Q13232 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME3Q13232 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME3Q13232 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME3Q13232 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME3Q13232 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NME3Q13232 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME3Q13232 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME3Q13232 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME3Q13232 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME3Q13232 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME3Q13232 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME3Q13232 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME3Q13232 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NME3Q13232 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME3Q13232 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME3Q13232 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME3Q13232 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME3Q13232 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME3Q13232 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME3Q13232 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME3Q13232 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NME3Q13232 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME3Q13232 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME3Q13232 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NME3Q13232 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NME3Q13232 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NME3Q13232 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NME3Q13232 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NME3Q13232 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME3Q13232 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME3Q13232 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME3Q13232 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME3Q13232 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME3Q13232 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME3Q13232 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME3Q13232 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NME3Q13232 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME3Q13232 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME3Q13232 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME3Q13232 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME3Q13232 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME3Q13232 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME3Q13232 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME3Q13232 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME3Q13232 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NME3Q13232 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME3Q13232 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME3Q13232 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME3Q13232 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME3Q13232 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME3Q13232 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME3Q13232 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME3Q13232 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME3Q13232 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME3Q13232 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME3Q13232 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NME3Q13232 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NME3Q13232 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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