Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ECH1Q13011 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECH1Q13011 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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