Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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TSPAN31Q12999 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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TSPAN31Q12999 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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TSPAN31Q12999 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN31Q12999 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN31Q12999 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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