Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX10Q12887 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX10Q12887 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX10Q12887 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX10Q12887 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX10Q12887 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX10Q12887 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX10Q12887 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COX10Q12887 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX10Q12887 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX10Q12887 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX10Q12887 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX10Q12887 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX10Q12887 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX10Q12887 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX10Q12887 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX10Q12887 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX10Q12887 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX10Q12887 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX10Q12887 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX10Q12887 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX10Q12887 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX10Q12887 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX10Q12887 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX10Q12887 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX10Q12887 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX10Q12887 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX10Q12887 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX10Q12887 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX10Q12887 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX10Q12887 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX10Q12887 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX10Q12887 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COX10Q12887 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX10Q12887 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX10Q12887 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX10Q12887 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX10Q12887 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX10Q12887 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX10Q12887 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX10Q12887 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX10Q12887 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX10Q12887 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX10Q12887 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX10Q12887 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX10Q12887 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COX10Q12887 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COX10Q12887 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COX10Q12887 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COX10Q12887 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX10Q12887 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX10Q12887 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX10Q12887 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX10Q12887 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX10Q12887 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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