Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBRQ0VD83 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.57■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.57■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.56■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.55■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.55■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.52■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
APOBRQ0VD83 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms