Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD47Q08722 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD47Q08722 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD47Q08722 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD47Q08722 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD47Q08722 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD47Q08722 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD47Q08722 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD47Q08722 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD47Q08722 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD47Q08722 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD47Q08722 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD47Q08722 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD47Q08722 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD47Q08722 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD47Q08722 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD47Q08722 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD47Q08722 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD47Q08722 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD47Q08722 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD47Q08722 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD47Q08722 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD47Q08722 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD47Q08722 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD47Q08722 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD47Q08722 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD47Q08722 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD47Q08722 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD47Q08722 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD47Q08722 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD47Q08722 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD47Q08722 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD47Q08722 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD47Q08722 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD47Q08722 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD47Q08722 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD47Q08722 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD47Q08722 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD47Q08722 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD47Q08722 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD47Q08722 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD47Q08722 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD47Q08722 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CD47Q08722 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD47Q08722 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD47Q08722 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD47Q08722 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD47Q08722 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD47Q08722 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD47Q08722 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD47Q08722 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD47Q08722 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD47Q08722 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD47Q08722 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD47Q08722 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD47Q08722 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD47Q08722 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD47Q08722 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD47Q08722 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD47Q08722 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD47Q08722 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD47Q08722 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD47Q08722 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD47Q08722 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD47Q08722 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD47Q08722 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD47Q08722 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD47Q08722 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD47Q08722 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD47Q08722 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD47Q08722 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD47Q08722 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD47Q08722 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD47Q08722 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD47Q08722 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD47Q08722 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD47Q08722 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD47Q08722 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD47Q08722 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD47Q08722 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD47Q08722 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD47Q08722 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD47Q08722 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD47Q08722 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD47Q08722 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD47Q08722 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD47Q08722 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms