Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP3CAQ08209 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms