Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRTAP1-1Q07627 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms