Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CXCL9Q07325 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CXCL9Q07325 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CXCL9Q07325 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.5 ms