Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EGR3Q06889 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EGR3Q06889 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms