Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFF2Q03403 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFF2Q03403 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF2Q03403 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms