Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF8Q02556 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms