Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A3Q01959 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A3Q01959 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A3Q01959 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms