Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAP1Q01518 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAP1Q01518 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAP1Q01518 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAP1Q01518 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms