Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSG6Q00889 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSG6Q00889 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG6Q00889 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG6Q00889 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG6Q00889 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG6Q00889 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG6Q00889 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG6Q00889 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG6Q00889 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG6Q00889 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG6Q00889 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG6Q00889 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSG6Q00889 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG6Q00889 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms