Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2BQ00403 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GTF2BQ00403 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2BQ00403 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2BQ00403 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms