Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED6P86452 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED6P86452 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED6P86452 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms