Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NTHL1P78549 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTHL1P78549 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTHL1P78549 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTHL1P78549 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms