Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN10P78369 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN10P78369 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN10P78369 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN10P78369 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN10P78369 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN10P78369 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN10P78369 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms