Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HBBP68871 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HBBP68871 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HBBP68871 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HBBP68871 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HBBP68871 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HBBP68871 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HBBP68871 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HBBP68871 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HBBP68871 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HBBP68871 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HBBP68871 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HBBP68871 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HBBP68871 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HBBP68871 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HBBP68871 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HBBP68871 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HBBP68871 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HBBP68871 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HBBP68871 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HBBP68871 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HBBP68871 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HBBP68871 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HBBP68871 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HBBP68871 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HBBP68871 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HBBP68871 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HBBP68871 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HBBP68871 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HBBP68871 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HBBP68871 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HBBP68871 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HBBP68871 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HBBP68871 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HBBP68871 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HBBP68871 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HBBP68871 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HBBP68871 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HBBP68871 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HBBP68871 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HBBP68871 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HBBP68871 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HBBP68871 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HBBP68871 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HBBP68871 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HBBP68871 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HBBP68871 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HBBP68871 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HBBP68871 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HBBP68871 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HBBP68871 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HBBP68871 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HBBP68871 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HBBP68871 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HBBP68871 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HBBP68871 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HBBP68871 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HBBP68871 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HBBP68871 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HBBP68871 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HBBP68871 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HBBP68871 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HBBP68871 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms