Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKP1P63208 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKP1P63208 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKP1P63208 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKP1P63208 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKP1P63208 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKP1P63208 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKP1P63208 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKP1P63208 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKP1P63208 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKP1P63208 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKP1P63208 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKP1P63208 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKP1P63208 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP1P63208 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP1P63208 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP1P63208 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP1P63208 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP1P63208 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP1P63208 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP1P63208 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP1P63208 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP1P63208 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP1P63208 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP1P63208 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKP1P63208 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKP1P63208 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKP1P63208 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKP1P63208 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP1P63208 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP1P63208 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP1P63208 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP1P63208 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP1P63208 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP1P63208 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP1P63208 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP1P63208 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP1P63208 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP1P63208 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP1P63208 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKP1P63208 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKP1P63208 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKP1P63208 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKP1P63208 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKP1P63208 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKP1P63208 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKP1P63208 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKP1P63208 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKP1P63208 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKP1P63208 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP1P63208 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP1P63208 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP1P63208 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP1P63208 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP1P63208 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP1P63208 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP1P63208 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP1P63208 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP1P63208 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP1P63208 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP1P63208 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP1P63208 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP1P63208 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP1P63208 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP1P63208 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP1P63208 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP1P63208 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP1P63208 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP1P63208 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP1P63208 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP1P63208 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP1P63208 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP1P63208 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP1P63208 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP1P63208 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP1P63208 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP1P63208 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP1P63208 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP1P63208 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP1P63208 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKP1P63208 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKP1P63208 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKP1P63208 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKP1P63208 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKP1P63208 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKP1P63208 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKP1P63208 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKP1P63208 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKP1P63208 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP1P63208 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP1P63208 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP1P63208 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP1P63208 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP1P63208 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP1P63208 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP1P63208 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP1P63208 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP1P63208 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP1P63208 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms