Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL23AP62750 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23AP62750 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms