Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P61574 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms