Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL3P58215 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL3P58215 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms