Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMP55040 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMP55040 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMP55040 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMP55040 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEMP55040 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMP55040 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMP55040 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMP55040 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMP55040 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEMP55040 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEMP55040 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMP55040 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMP55040 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMP55040 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMP55040 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEMP55040 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEMP55040 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEMP55040 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEMP55040 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEMP55040 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMP55040 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMP55040 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMP55040 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMP55040 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMP55040 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMP55040 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GEMP55040 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMP55040 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMP55040 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMP55040 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMP55040 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMP55040 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMP55040 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMP55040 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMP55040 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMP55040 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMP55040 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMP55040 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMP55040 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMP55040 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMP55040 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMP55040 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMP55040 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMP55040 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMP55040 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMP55040 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMP55040 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMP55040 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMP55040 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMP55040 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMP55040 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMP55040 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMP55040 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMP55040 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMP55040 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMP55040 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMP55040 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMP55040 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMP55040 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMP55040 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMP55040 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMP55040 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms