Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOSBP53539 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOSBP53539 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOSBP53539 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FOSBP53539 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOSBP53539 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOSBP53539 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOSBP53539 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOSBP53539 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOSBP53539 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FOSBP53539 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FOSBP53539 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOSBP53539 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOSBP53539 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FOSBP53539 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOSBP53539 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOSBP53539 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FOSBP53539 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOSBP53539 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FOSBP53539 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FOSBP53539 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FOSBP53539 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOSBP53539 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOSBP53539 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOSBP53539 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOSBP53539 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOSBP53539 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOSBP53539 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOSBP53539 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOSBP53539 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOSBP53539 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOSBP53539 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOSBP53539 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOSBP53539 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOSBP53539 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOSBP53539 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOSBP53539 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOSBP53539 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOSBP53539 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOSBP53539 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOSBP53539 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOSBP53539 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOSBP53539 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOSBP53539 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOSBP53539 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOSBP53539 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOSBP53539 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOSBP53539 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOSBP53539 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOSBP53539 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOSBP53539 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOSBP53539 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOSBP53539 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOSBP53539 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOSBP53539 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOSBP53539 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOSBP53539 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOSBP53539 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FOSBP53539 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOSBP53539 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOSBP53539 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOSBP53539 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOSBP53539 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOSBP53539 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOSBP53539 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOSBP53539 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOSBP53539 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOSBP53539 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOSBP53539 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOSBP53539 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOSBP53539 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOSBP53539 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FOSBP53539 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOSBP53539 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOSBP53539 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOSBP53539 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOSBP53539 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOSBP53539 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOSBP53539 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOSBP53539 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOSBP53539 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOSBP53539 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOSBP53539 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOSBP53539 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOSBP53539 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOSBP53539 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOSBP53539 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOSBP53539 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOSBP53539 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FOSBP53539 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOSBP53539 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOSBP53539 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOSBP53539 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOSBP53539 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOSBP53539 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOSBP53539 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOSBP53539 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOSBP53539 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOSBP53539 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOSBP53539 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms