Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMSP52788 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMSP52788 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMSP52788 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMSP52788 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMSP52788 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMSP52788 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMSP52788 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMSP52788 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMSP52788 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMSP52788 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMSP52788 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMSP52788 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMSP52788 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMSP52788 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMSP52788 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMSP52788 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMSP52788 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMSP52788 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMSP52788 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMSP52788 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMSP52788 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMSP52788 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMSP52788 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMSP52788 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMSP52788 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMSP52788 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMSP52788 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMSP52788 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMSP52788 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMSP52788 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMSP52788 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMSP52788 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMSP52788 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMSP52788 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMSP52788 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMSP52788 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMSP52788 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMSP52788 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMSP52788 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMSP52788 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMSP52788 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMSP52788 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMSP52788 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMSP52788 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMSP52788 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMSP52788 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMSP52788 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMSP52788 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMSP52788 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMSP52788 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMSP52788 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMSP52788 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMSP52788 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMSP52788 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMSP52788 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMSP52788 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMSP52788 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms