Protein–RNA interactions for Protein: P51826

AFF3, AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3P51826 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFF3P51826 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF3P51826 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF3P51826 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF3P51826 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF3P51826 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF3P51826 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF3P51826 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF3P51826 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF3P51826 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF3P51826 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF3P51826 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF3P51826 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF3P51826 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF3P51826 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF3P51826 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF3P51826 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF3P51826 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF3P51826 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF3P51826 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF3P51826 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF3P51826 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF3P51826 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF3P51826 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF3P51826 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF3P51826 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF3P51826 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF3P51826 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFF3P51826 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFF3P51826 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFF3P51826 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFF3P51826 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFF3P51826 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFF3P51826 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFF3P51826 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFF3P51826 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFF3P51826 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AFF3P51826 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AFF3P51826 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFF3P51826 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AFF3P51826 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFF3P51826 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFF3P51826 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFF3P51826 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFF3P51826 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFF3P51826 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFF3P51826 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFF3P51826 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFF3P51826 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFF3P51826 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFF3P51826 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFF3P51826 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFF3P51826 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFF3P51826 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFF3P51826 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFF3P51826 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFF3P51826 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFF3P51826 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFF3P51826 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFF3P51826 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFF3P51826 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFF3P51826 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFF3P51826 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFF3P51826 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFF3P51826 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFF3P51826 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFF3P51826 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFF3P51826 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFF3P51826 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFF3P51826 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFF3P51826 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFF3P51826 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFF3P51826 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFF3P51826 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFF3P51826 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFF3P51826 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFF3P51826 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF3P51826 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF3P51826 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF3P51826 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF3P51826 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF3P51826 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF3P51826 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF3P51826 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF3P51826 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF3P51826 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF3P51826 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF3P51826 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF3P51826 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF3P51826 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF3P51826 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF3P51826 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF3P51826 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF3P51826 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF3P51826 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF3P51826 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF3P51826 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF3P51826 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF3P51826 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFF3P51826 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms