Protein–RNA interactions for Protein: P51513

NOVA1, RNA-binding protein Nova-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA1P51513 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NOVA1P51513 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOVA1P51513 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOVA1P51513 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NOVA1P51513 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms